O mGWAS (Metabolome Genome-Wide Association Study) refere-se à análise de associação de todo o genoma baseada em metabólica e é um método para associar dados metabólicos a dados genótipos como fenótipos. Como os dados metabólicos são mais refinados para a identificação de fenótipos, a análise de associação é mais precisa do que a análise GWAS tradicional.

A equipe de professores Roger da Universidade de Hainan e da Universidade Agrária da ChinaA área de mGWAS tem sido bem estabelecida, com mais de 10 estudos publicados nos últimos anos em revistas de alta pontuação.

Em 7 de dezembro de 2020, a revista Nature Plants publicou on-line um novo artigo da equipe do professor Roger, Selection of a subspecies-specific diterpene gene cluster implicated in rice disease resistance, que analisa em profundidade os clusters genéticos relacionados à via sintética de compostos biterpenos no arroz. Um dos principais tipos de antimicrobianos vegetais no arroz, os compostos biterpenoides, este estudo encontrou um gene que codifica completamente toda a via de biosíntese do 5,10-bicetoricinene (membro do derivado do ricinene monocíclico) no cromossomo 7 (DGC7).Cluster.

Artigos usando técnicas de detecção de grupos metabólicos- Tecnologia de detecção metabólica amplamente direcionada para alcançar um alto fluxo, alta sensibilidade, ampla cobertura e proximidade de detecção sem diferenças1.000 metabólitos que auxiliam a pesquisa metabólica e multiômica.

Identificação de agrupamentos genéticos de terpenos no arroz

Este estudo usou um espectrômetro de massa triplo quadrupolo de cromatografia líquida de alta eficiênciaLCMS-8060， A análise do espectro metabólico de folhas de tabaco Benson infectadas ou não infectadas com o candidato correspondente foi feita e o 10-ceto-ricinene e o 5,10-biceto-ricinene foram purificados a partir de folhas de arroz.

Espectrograma de massa do 5,10-bisceto-ricinene

Gráficoa Produto da sobreexpressão simultânea de OsTPS28, OsCYP71Z2 e OsCYP71Z21 nas folhas de tabaco de Benson

Gráficob é um produto padrão de 5,10-biscetona-ricinene

Espectrómetro de massa em série usado neste artigoLCMS-8060 e GCMS-TQ8040 (fotografado no Laboratório de Reforma Genética de Cultivos da Universidade Agrária da China)